Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms