Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Brms1Q99N20 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brms1Q99N20 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms