Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gdpd3Q99LY2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms