Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp3Q91W36 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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