Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fam20bQ8VCS3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms