Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubxn4Q8VCH8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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