Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Impg1Q8R1W8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Impg1Q8R1W8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms