Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mkl1Q8K4J6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mkl1Q8K4J6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms