Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrtm1Q8K377 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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