Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
FgbQ8K0E8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FgbQ8K0E8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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