Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.2 ms