Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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