Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp44Q8C2S0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp44Q8C2S0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp44Q8C2S0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp44Q8C2S0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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