Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q8BGC1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q8BGC1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q8BGC1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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