Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
IfnkQ7TSL0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms