Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Actn1Q7TPR4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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