Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shq1Q7TMX5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms