Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam107aQ78TU8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam107aQ78TU8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fam107aQ78TU8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107aQ78TU8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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