Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Topbp1Q6ZQF0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms