Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp49Q6P9L4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp49Q6P9L4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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