Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Foxd1Q61345 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms