Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnot7Q60809 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnot7Q60809 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms