Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sin3aQ60520 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3aQ60520 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms