Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rnf123Q5XPI3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms