Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms