Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim58Q5NCC9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms