Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp48Q3V0C5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp48Q3V0C5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp48Q3V0C5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp48Q3V0C5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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