Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn4Q3UWL8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms