Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SfswapQ3USH5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SfswapQ3USH5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SfswapQ3USH5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SfswapQ3USH5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SfswapQ3USH5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms