Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem253Q3UNB8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms