Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ankrd27Q3UMR0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd27Q3UMR0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms