Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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