Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gpr55Q3UJF0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms