Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Nkx6-3Q3UHX8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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