Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms