Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Cops9Q3U898 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms