Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U6N9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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