Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Fam117bQ3U3E2 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam117bQ3U3E2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms