Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdnep1Q3TP92 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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