Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
XylbQ3TNA1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
XylbQ3TNA1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms