Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec11Q3SXB8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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