Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
StumQ0VBF8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms