Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spata18Q0P557 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms