Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc21bQ0HA38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms