Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms