Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs3Q05895 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Thbs3Q05895 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms