Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms