Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mc1rQ01727 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms