Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec23aQ01405 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sec23aQ01405 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms