Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gbp10Q000W5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms